Samos mimarisi diğer Kuzeydoğu Ege adalarının mimarisine benzer. Samos adasının nüfusu ağırlıklı olarak hetorojen (ayrı cinsten) kökenli olduğu için adada kendine özgü bir mimari yoktur. 

Adaya bakıldığında Bizans kiliseleri, Neoklasik konaklar, Venedik tarzı binalar, beyaz badanalı evler hepsi birarada görülmektedir. Dar sokaklar tüm bu yapıların etrafını sararak atmosfere sıcak ve rahatlatıcı bir dokunuş katmaktadır. 

Adanın başkenti olan Vathy’de Neoklasik evler ile Venedik tarzı evler birbiriyle içiçe olup tüm yapılar kırmızı kiremitli ve bazıları parlak renklerde badanalıdır. Kasabanın dar caddeleri ve merdivenleri mavi beyaz renklerde boyalı, binaların duvarları resimlerle süslüdür. 

Adanın güneyindeki şirin sahil kasabası olan Pythagorion mavi kapıları ve panjurları olan beyaz badanalı evlerle doludur. 

Arkaik tapınaklar, Bizans ve Bizans sonrası dönemlere tarihlenen muhteşem freskoları olan kiliseler adanın mimarisinde tamamlayıcı roldedir.